官文请求耆龄发放军饷，让他转移镇守的地方。
当时曾国藩侍郎办理福建省的军务，将要从杉关进入邵武，然而军士中患病的达三千多人。
福建省的顺昌、将乐，汀州也渐渐肃清了敌寇，因此官文又上奏请求让侍郎办理安徽省的军务，并说巡抚胡林翼在十月二十五日葬送亲人以后，不可以仍然拘泥于假期未结束而不去赴任。
但胡林翼原本打算假期满后请求继续休假，来坚守自己初时的心志。然而皇帝的命令紧急，有“现在军务紧急，你不要太过拘泥于丧期未过而贻误了战机”的话。
胡林翼不得已，“哭泣着接受命令”，于是在十一月十二日在益阳本籍起程，十一月三十日抵达湖北。
胡林翼在十一月十二日上奏说：“身经百战之后，一旦失败，军心已经受到了极大的打击。
不仅眼下的形势已经到了不可收拾的地步，而且恐怕伤员太多，不是短时间内可以重新振作起来的。
以我的才能和力量怎么能补救得了呢，我现在仍然在湖南招募士兵，来为以后做打算。
我的葬祭之事还没有完全结束，请皇大大人您等候一下等军务完毕后再行陈述清楚。”
十月十四日，官文用快递向都将军发文，趁着夜色撤退各个营地，从石牌退到扎宿松。
不久之后李续宜、成大吉、舒保等人先后到达，军队的气势才开始壮起来。
于是他们在黄泥港开始迎击敌人，杀死敌人数千。
又在王家畈进行剿敌，平定了三十多个营地，斩杀敌人数千，俘虏五百多人。
余际昌、唐训方又在南阳河、弥陀寺大败敌军，追杀了三十多里。都将军又在花凉亭打败了敌军。
各军丧失了主将，就退驻到枫香驿、莲花塘，又到达太湖和东岸的龙山宫。
荆桥的敌军先到芬茅岭又退到石牌，聚合下游的敌军，增修堡垒；另一股敌军越过潜山向天堂进发，从黄沙岭侵犯英、霍两县的东岭；又一股敌军向五河进发，从隘口进犯英山夹铺。
都兴阿将军派遣唐训方、阿达前往陈德园阻击；派遣余际昌进驻大畈河，扼守从潜山到英山的道路；派遣蒋凝学进驻荆桥，牵制石牌敌军的势力。
十二月初七，多隆阿翼长把军营搬到了二十五里墩，白莲花塘进攻太湖，鲍超的军队从二郎河进攻。
当时将军因为脚伤请了一个月的假，在宿松治疗，前线事务交给了多隆阿翼长负责，楚地局势逐渐稳定。
胜保招募的川、楚士兵两千五百名已经从寿州出发。
胡林翼在十一月三十日抵达鄂，没有进入抚署，而是住在贡院，与多隆阿翼长商量军事事务以及处理违纪将士。
接着，胡林翼在十二月初八前往黄州，整顿散兵，安抚伤亡将士，训练新兵，严格纪律，为将来做准备。
十二月初二，胡林翼指示总兵普承尧驻扎九江。
胡林翼认为应该驻扎在彭泽、湖口。
初四，胡林翼公告诉黄冈县令薛元启威：“按粮捐输，实际上就是亩费的别名，势必会让大户、大绅因为带兵而得利，而小户、穷民会先遭受损失，所以不应该讨论。”
胡林翼告诉罗登汝：“治理人民就像医生治病，脉象不清晰，即使每天吃很多药，对病也没有好处。